كافئين يكي از بحث‌ برانگيز‌ترين موادي است كه پزشكان همواره در مورد تاثيرات آن روي بيماري‌هاي خاص دچار اختلاف نظرند.
به عنوان مثال گاهي پزشكان آن را براي مقابله با بسياري از بيماري‌ها توصيه و گاهي به شدت مصرف كافئين را منع مي‌كنند.
يكي از بيماري‌هايي كه هميشه بر سر تاثير كافئين روي آن اختلاف نظر وجود داشته، سرطان سينه است. هرچند برخي پزشكان معتقدند بين مصرف كافئين و افزايش خطر ابتلا به سرطان سينه ارتباط وجود دارد اما تحقيقات اخير نشان مي دهد كه كافئين در ايجاد اين نوع از سرطان نقشي ندارد.
با اين حال توصيه مي‌شود در صورتي كه در خانواده سابقه ابتلا به سرطان سينه وجود دارد در مصرف كافئين زياده‌روي نشود.