به علت عدم وجود نرم افزارهای ضد ویروس لینوکس به میزان کافی احتمال آسیب‎پذیری شرکت ها و موسساتی که از این سیستم عامل استفاده می کنند، بسیار زیاد است.
شرکت Network Associates که به تازگی اولین نرم افزار ضد ویروس سرور لینوکس را عرضه کرده، بر لزوم ایجاد آمادگی در برابر حملات احتمالی تاکید کرد.
این هشدارها در حالی عنوان می شود که برخی کارشناسان معتقدند به علت ایمنی بالاتر لینوکس نسبت به ویندوز چندان جای نگرانی وجود ندارد. اما به هر حال کسب آمادگی ضروری است.
گفتنی است که از سال 1998 تا کنون تنها سه ویروس بر ضد سیستم عامل لینوکس طراحی شده است.