بایرن مونیخ در مرحله نیمه نهایی جام اتحادیه با نتیجه 2 بر یک مقابل اشتوتگارت تن به شکست داد تا اولین بازی کریمی با پیراهن این تیم این دیدار در استادیوم المپیک مونیخ برگزار شد و تیم میزبان در حالی که بازی با نتیجه مساوی یک بر یک پیش می رفت در آخرین دقیقه بازی گل خورد تا در کمال ناباوری از دور رقابت‌ها کنار برود.
کریمی در آغاز نیمه دوم وارد زمین شد تا نخستین بازی رسمی خود را به همراه بایرن تجربه کند. در این نیمه تیم فوتبال بایرن کاملا بر بازی تسلط پیدا کرد و بارها دروازه اشتوتگارت را با خطر مواجه ساخت، اما تیمو هیلده براند با درخشش خود در این دیدار مانع از فرو ریختن دروازه تیمش شد تا به عنوان مرد اول میدان لقب بگیرد. پس از این بازی فیلیکس ماگات از بازی علی کریمی اظهار نارضایتی کرد.