با صدور «شناسنامه سلامت مدارس» از سال تحصيلي جديد‏، سطح ايمني و بهداشت مدارس ارتقا مي‌يابد.
بر اساس جزئيات طرح نظام مراقبت در سطح PHC دانش‌آموزان براي گروه سني 6 تا 18 سال، كميته شناسنامه سلامت اين طرح در نظر گرفته است تا از سال تحصيلي آينده مدارس نيز علاوه بر دانش‌آموزان از شناسنامه سلامت برخوردار شوند.
بنابراين «شناسنامه سلامت مدرسه» به عنوان ابزاري جهت ثبت داده‌هاي بهداشتي مرتبط با محيط مدارس كشور طراحي شده است.
در اين شناسنامه نام مدرسه، مقطع، جنسيت، نوع مدرسه، تعداد كلاس و تعداد دانش‌آموزان ‌ثبت شده، با استفاده از برنامه بكفا و در صورت به روز نبودن، از سوي سازمان يا منطقه آموزش و پرورش تكميل خواهد شد.
بر اين اساس وضعيت «سرويس‏هاي بهداشتي» مدارس نظير كيفيت آب آشاميدني، آبخوري، توالت، دستشويي، سيستم دفع فاضلاب، زباله، وضعيت «بهداشت مواد غذايي» به لحاظ وجود بوفه، كارت معاينه پزشكي، رعايت بهداشت فردي متصدي بوفه، نحوه نگهداري مواد غذايي و مواد غذايي غيرمجاز، «ايمني سطح مدرسه» نظير سيم‌كشي برق ايمن، كپسول اطفاي حريق، ايمني مواد شيميايي قابل انفجار يا اشتعال، محل عبور و مرور دانش‌آموزان از عرض خيابان و «بهداشت محيط و محيط زيست» مورد بررسي قرار گرفته و در شناسنامه سلامت مدرسه ثبت مي‌شود.
متقيان، معاون دفتر سلامت و تندرستي آموزش و پرورش در اينباره با اعلام اين كه تنها 20 درصد مدارس استانداردهاي نسبي بهداشت را رعايت مي‌كنند، گفت: تاكنون ابزاري كه بتوان طبق آن مدارسي كه بهداشت را رعايت نمي‌كنند، بازخواست كرد، وجود نداشته است.